I 1963 lukkede det legendariske amerikanske fængsel Alcatraz. Det var for dyrt at drive fængsel på øen ud for San Fransisco og bygningerne var forældede. Derfor blev de 302 beboere flyttet til nye fængsler, mens øen ud for blev omdannet til turistmål. Men det var slet ikke det, der i virkeligheden skete. I hvert fald ikke hvis man skal tro JJ Abrams nye tvserie, Alcatraz.
For i virkeligheden forsvandt alle fængslets indsatte og fangevogtere pludseligt og uden spor. Ingen ved hvad der skete, og de er ikke set siden. Indtil nu, altså.