Kitaro est un jeune Yokai qui aime se réfugier dans les cimetières. Dernier representant de la tribu-fantome, les premiers terriens, on dit de lui qu'il est repoussant, à cause de son orbite oculaire gauche qui est vide. La faute à son beau-père, qui le déteste !
Un jour, il rencontre son père, qu'il croyait mort, mais il s'est réincarné en œil ! Ils restent ensemble pour le reste de leur vie. Mais ils se rendent compte qu'ils ne sont pas les seuls Yokai. Ils doivent maintenir l'équilibre entre les Yokai...